Proizvodi

Nealkoholna masna bolest jetre (NAFLD) ima širok spektar bolesnih stanja u rasponu od blage steatoze koju karakterizira abnormalno zadržavanje lipida unutar jetrenih stanica do steatohepatitisa (NASH) koji pokazuje nakupljanje masti, upalu, baloniranje i degradaciju hepatocita i fibrozu.U konačnici, steatohepatitis može rezultirati cirozom jetre i hepatocelularnim karcinomom. U ovoj studiji analizirali smo tri različita soja miševa, A/J, C57BL/6J i PWD/PhJ, koji pokazuju različite stupnjeve steatohepatitisa kada im se daje 3,5-dietoksikarbonil Dijeta koja sadrži -1,4-dihidrokolidin (DDC).Analiza ekspresije gena RNA-Seq, analiza proteina i metaboličko profiliranje primijenjeni su za identifikaciju različito izraženih gena/proteina i poremećenih razina metabolita u uzorcima mišje jetre nakon DDC-tretmana.Analiza puta otkrila je promjenu metabolizma arahidonske kiseline (AA) i S-adenozilmetionina (SAMe) na drugim putovima.Kako bi se razumjele metaboličke promjene metabolizma arahidonske kiseline u svjetlu profila ekspresije bolesti, razvijen je kinetički model ovog puta i optimiziran prema razinama metabolita.Nakon toga, model je korišten za proučavanje in silico učinaka potencijalnih meta lijekova za steatohepatitis. Identificirali smo metabolizam AA/eikosanoida kao vrlo poremećen u miševa izazvanih DDC-om koristeći kombinaciju eksperimentalnog i in silico pristupa.Naša analiza metaboličkog puta AA/eikosanoida sugerira da su 5-hidroksieikosatetraenska kiselina (5-HETE), 15-hidroksieikosatetraenska kiselina (15-HETE) i prostaglandin D2 (PGD2) poremećeni u DDC miševa.Nadalje pokazujemo da se dinamički model može koristiti za kvalitativno predviđanje metaboličkih promjena na temelju podataka o transkriptomiji u kontekstu povezanom s bolešću.Nadalje, utvrđeno je da je metabolizam SAMe poremećen zbog liječenja DDC-om.Nekoliko gena kao i neki metaboliti ovog modula pokazuju razlike između A/J i C57BL/6J s jedne strane i PWD/PhJ s druge strane.