Proizvodi

Infracrvena spektroskopija korištena je za mapiranje interakcija supstrat-protein: konformacijske promjene sarkoplazmatskog retikuluma Ca(2+)-ATPaze nakon vezanja nukleotida i fosforilacije ATPaze praćene su korištenjem supstrata ATP i ATP analoga (2'-deoksi-ATP, 3 '-deoksi-ATP i inozin 5'-trifosfat), koji su modificirani na specifičnim funkcionalnim skupinama supstrata.Modifikacije 2'-OH, 3'-OH i amino skupine adenina smanjuju opseg konformacijske promjene ATPaze izazvane vezanjem, s posebno jakim učincima uočenim za posljednje dvije.Ovo pokazuje strukturnu osjetljivost kompleksa nukleotid-ATPaza na pojedinačne interakcije između nukleotida i ATPaze.Sve proučavane skupine važne su za vezanje, a interakcije određene ligandne skupine s ATP-azom ovise o interakcijama drugih ligandnih skupina.Fosforilacija ATPaze opažena je za ITP i 2'-deoksi-ATP, ali ne i za 3'-deoksi-ATP.Ne postoji izravna veza između opsega konformacijske promjene nakon vezanja nukleotida i brzine fosforilacije koja pokazuje da puni opseg konformacijske promjene izazvane ATP-om nije obavezan za fosforilaciju.Kao što je primijećeno za kompleks nukleotid-ATPaza, konformacija prvog fosforiliranog intermedijera ATPaze E1PCa(2) također ovisi o nukleotidu, što ukazuje da stanja ATPaze imaju manje jednoliku konformaciju nego što se ranije očekivalo.